بازگشت به دانشنامه ←
راهنمای خرید دستگاه Real-Time PCR
راهنمای انتخاب خرید۱۵ دقیقه مطالعه۱۳ بازدید

راهنمای خرید دستگاه Real-Time PCR

دستگاه Real-Time PCR یا qPCR یکی از مهم‌ترین تجهیزات آزمایشگاه‌های مولکولی است که امکان تکثیر و پایش DNA یا cDNA را به‌صورت هم‌زمان فراهم می‌کند. هنگام خرید دستگاه Real-Time PCR، تنها قیمت یا تعداد Wellها نباید معیار انتخاب باشد؛ تعداد کانال‌های فلورسنت، سازگاری با رنگ‌های مورد استفاده در کیت‌ها، دقت و یکنواختی حرارتی، سرعت دستگاه، سیستم اپتیکی، قابلیت Multiplex، نرم‌افزار تحلیل و خدمات پس از فروش از عوامل مهم هستند. انتخاب صحیح دستگاه باید بر اساس نوع آزمایش‌ها، تعداد نمونه روزانه و برنامه توسعه آینده آزمایشگاه انجام شود.

راهنمای انتخاب و خرید

راهنمای خرید دستگاه Real-Time PCR

چگونه بهترین دستگاه qPCR را انتخاب کنیم؟

پاسخ کوتاه
  • ابتدا نوع آزمایش‌ها و تعداد نمونه‌های روزانه آزمایشگاه را مشخص کنید.
  • تعداد کانال‌های فلورسنت را بر اساس کیت‌ها و تست‌های Multiplex مورد استفاده انتخاب کنید.
  • دقت و یکنواختی حرارتی دستگاه از مشخصات مهم در کیفیت و تکرارپذیری نتایج است.
  • ظرفیت ۹۶ خانه برای بسیاری از آزمایشگاه‌های مولکولی انتخاب متداولی است، اما ظرفیت مناسب به حجم کاری بستگی دارد.
  • پیش از خرید، خدمات پس از فروش، قطعات یدکی، نرم‌افزار، کالیبراسیون و سازگاری دستگاه با مواد مصرفی را بررسی کنید.

دستگاه Real-Time PCR چیست؟

دستگاه Real-Time PCR یا Real-Time Polymerase Chain Reaction System نوع پیشرفته‌ای از ترمال سایکلر است که علاوه بر تکثیر DNA، میزان تولید محصول PCR را در طول واکنش و با استفاده از سیگنال‌های فلورسنت پایش می‌کند.

در PCR معمولی، محصول واکنش معمولاً پس از پایان PCR با روش‌هایی مانند الکتروفورز ژل بررسی می‌شود. اما در Real-Time PCR، دستگاه در طول چرخه‌های تکثیر میزان فلورسانس را اندازه‌گیری کرده و اطلاعات لازم برای تحلیل واکنش را در اختیار کاربر قرار می‌دهد.

این ویژگی باعث شده Real-Time PCR در تشخیص مولکولی، بررسی عوامل عفونی، تحقیقات ژنتیکی، بررسی بیان ژن و بسیاری از کاربردهای تحقیقاتی و تشخیصی مورد استفاده قرار گیرد.

دستگاه Real-Time PCR چگونه کار می‌کند؟

Real-Time PCR دو سیستم اصلی را در یک دستگاه ترکیب می‌کند:

Thermal Cycling
  • ایجاد چرخه‌های دمایی PCR
  • Denaturation
  • Annealing
  • Extension
Optical Detection
  • تحریک فلوروفورها
  • اندازه‌گیری سیگنال فلورسنت
  • ارسال داده به نرم‌افزار
  • تحلیل Cq/Ct و منحنی‌ها

در طول واکنش، افزایش محصول PCR باعث افزایش سیگنال فلورسنت می‌شود. دستگاه این سیگنال را در چرخه‌های مختلف اندازه‌گیری کرده و نرم‌افزار بر اساس منحنی‌های Amplification اطلاعاتی مانند Cq/Ct را برای تحلیل کیفی یا کمی استخراج می‌کند.

مهم‌ترین اجزای دستگاه Real-Time PCR

بخشوظیفه
Thermal Blockایجاد و کنترل چرخه‌های دمایی
Heated Lidجلوگیری از تبخیر و میعان
Optical Systemتشخیص سیگنال‌های فلورسنت
Excitation Sourceتحریک فلوروفورها
Detectorدریافت سیگنال فلورسنت
کنترلر دستگاهمدیریت دما و چرخه‌ها
نرم‌افزارثبت و تحلیل داده‌ها

انواع دستگاه Real-Time PCR

دستگاه‌های ۴۸ خانه
  • مناسب حجم کاری پایین
  • تعداد نمونه کمتر
  • انتخاب مناسب برای آزمایشگاه‌های کوچک‌تر
دستگاه‌های ۹۶ خانه
  • رایج در آزمایشگاه‌های تشخیصی
  • تعادل مناسب ظرفیت و انعطاف‌پذیری
  • مناسب بسیاری از آزمایشگاه‌های مولکولی
دستگاه‌های ۳۸۴ خانه
  • High-Throughput
  • مراکز تحقیقاتی
  • آزمایشگاه‌های مرجع
سیستم‌های روتاری
  • طراحی متفاوت از بلوک‌های متداول
  • نمونه‌ها داخل روتور قرار می‌گیرند
  • نمونه شناخته‌شده: Rotor-Gene

مهم‌ترین مشخصات فنی هنگام خرید Real-Time PCR

تعداد کانال‌های فلورسنت
ظرفیت دستگاه
Temperature Accuracy
Temperature Uniformity
Ramp Rate
کیفیت سیستم اپتیکی
Multiplex Capability
نرم‌افزار و تحلیل داده

تعداد کانال‌های فلورسنت

یکی از اولین مشخصاتی که باید بررسی شود، تعداد کانال‌های قابل تشخیص دستگاه است. اگر آزمایشگاه قصد انجام تست‌های Multiplex را دارد، تعداد و مشخصات کانال‌های دستگاه اهمیت بیشتری پیدا می‌کند.

FAM
فلوروفور پرکاربرد در بسیاری از کیت‌ها
VIC / HEX
کانال متداول برای Multiplex
ROX / Texas Red
فلوروفورهای متداول قرمز
Cy5
کانال طیف قرمز دور
Cy5.5
در برخی سیستم‌های چندکاناله

صرفاً به عبارت «۴ کاناله» یا «۶ کاناله» اکتفا نکنید؛ طول موج‌های تحریک و نشر و سازگاری واقعی دستگاه با فلوروفورهای کیت‌های مورد استفاده را بررسی کنید.

ظرفیت دستگاه

ظرفیتمناسب برای
۴۸ Wellحجم کاری پایین
۹۶ Wellبیشتر آزمایشگاه‌های مولکولی
۳۸۴ WellHigh-Throughput و تحقیقات

خرید دستگاهی با ظرفیت بسیار بیشتر از نیاز می‌تواند هزینه اولیه و هزینه‌های عملیاتی را افزایش دهد، در حالی که ظرفیت کمتر از نیاز نیز باعث افزایش تعداد Runها خواهد شد.

دقت و یکنواختی حرارتی

Temperature Accuracy
  • میزان نزدیکی دمای واقعی به دمای تعیین‌شده
  • مهم برای اجرای صحیح پروفایل حرارتی
  • اثر مستقیم بر تکرارپذیری
Temperature Uniformity
  • میزان یکنواخت بودن دما میان Wellهای مختلف
  • کاهش اختلاف عملکرد بین نقاط Plate
  • مهم برای نتایج قابل اعتماد

عدم یکنواختی حرارتی می‌تواند باعث تفاوت عملکرد واکنش در نقاط مختلف Plate و کاهش تکرارپذیری شود.

Ramp Rate چیست؟

Ramp Rate نشان‌دهنده سرعت تغییر دمای دستگاه بین مراحل مختلف PCR است و معمولاً با °C/s بیان می‌شود. Ramp Rate بالاتر می‌تواند زمان Run را کاهش دهد، اما سرعت بالاتر به‌تنهایی به معنای دستگاه بهتر نیست. کنترل دقیق و یکنواخت دما نیز اهمیت زیادی دارد.

سیستم اپتیکی

سیستم اپتیکی وظیفه تحریک فلوروفورها و اندازه‌گیری نور منتشرشده از واکنش را بر عهده دارد.

حساسیت
تفکیک کانال‌ها
Crosstalk
قابلیت Multiplex
تکرارپذیری اندازه‌گیری

قابلیت Multiplex

Multiplex Real-Time PCR امکان بررسی چند Target را در یک واکنش فراهم می‌کند. اگر آزمایشگاه از کیت‌های Multiplex استفاده می‌کند یا قصد توسعه تست‌های چندهدفه را دارد، تعداد کانال‌های مستقل و توانایی دستگاه در تفکیک فلوروفورها اهمیت زیادی خواهد داشت.

نرم‌افزار دستگاه

📈
Amplification
  • Amplification Curve
  • Cq/Ct Analysis
  • Standard Curve
🔢
Quantification
  • Absolute Quantification
  • Relative Quantification
🔥
Melting
  • Melt Curve
  • HRM در دستگاه‌های پشتیبانی‌کننده
🧬
Genotyping
  • Genotyping
  • Allelic Discrimination
🎯
Multiplex Analysis
  • تحلیل چند Target
  • تفکیک کانال‌ها

هنگام خرید بررسی کنید که نرم‌افزار نیاز به لایسنس جداگانه دارد یا همراه دستگاه ارائه می‌شود.

کاربردهای دستگاه Real-Time PCR

🦠
تشخیص عوامل عفونی
  • HPV
  • HBV
  • HCV
  • HIV
  • ویروس‌های تنفسی
  • عوامل باکتریایی و انگلی
🧬
ژنتیک پزشکی
  • بررسی برخی واریانت‌های شناخته‌شده
  • Genotyping
  • Copy Number در کاربردهای مناسب
  • برخی تست‌های غربالگری مولکولی
🎗️
سرطان‌شناسی مولکولی
  • تست‌های هدفمند ژنی
  • بررسی برخی واریانت‌های سرطان
📊
بررسی بیان ژن
  • RT-qPCR
  • Relative Gene Expression
  • Absolute Gene Expression
🔬
تحقیقات
  • Gene Expression
  • Genotyping
  • Validation
  • Microbial Quantification
  • بررسی عملکرد ژن‌ها

مزایا و محدودیت‌های Real-Time PCR

مزایا
  • سرعت بالا در تکثیر و تحلیل DNA
  • امکان مشاهده روند واکنش در زمان واقعی
  • حساسیت و دامنه دینامیکی مناسب در کاربردهای معتبرشده
  • عدم نیاز معمول به الکتروفورز ژل برای خوانش qPCR
  • امکان انجام آزمایش‌های Multiplex در دستگاه‌های مناسب
  • قابلیت Quantification
  • مناسب برای کاربردهای تشخیصی و تحقیقاتی
محدودیت‌ها
  • قیمت بالاتر نسبت به Thermal Cycler معمولی
  • نیاز به مواد و کیت‌های سازگار با Real-Time PCR
  • حساسیت نتایج به طراحی Primer و Probe و شرایط واکنش
  • نیاز به کنترل دقیق آلودگی و کیفیت نمونه
  • محدودیت تعداد Targetهای هم‌زمان بر اساس کانال‌های دستگاه
  • هزینه تعمیر، سرویس و کالیبراسیون می‌تواند قابل‌توجه باشد

عوامل مؤثر بر کیفیت نتایج Real-Time PCR

کیفیت DNA یا RNA
طراحی صحیح Primer و Probe
کیفیت Master Mix
صحت Pipetting
جلوگیری از آلودگی
شرایط نگهداری معرف‌ها
کالیبراسیون دستگاه
عملکرد صحیح Thermal Block
عملکرد سیستم اپتیکی
انتخاب صحیح Threshold و روش تحلیل

مقایسه PCR معمولی و Real-Time PCR

ویژگیPCR معمولیReal-Time PCR
پایش تکثیرپس از واکنشحین واکنش
Quantificationمعمولاً خیربله
فلورسانسنیاز ندارداستفاده می‌شود
نیاز معمول به ژل برای خوانشبلهخیر
Multiplexمحدودترمناسب‌تر
قیمت دستگاهکمتربیشتر

برندهای مطرح دستگاه Real-Time PCR

🧬
برندهای شناخته‌شده
  • Applied Biosystems / Thermo Fisher Scientific
  • Bio-Rad
  • QIAGEN
  • Roche
  • Agilent Technologies
  • Analytik Jena
  • Bioneer
  • Sansure Biotech
📋
معیار انتخاب بین برندها
  • ظرفیت
  • کانال‌های فلورسنت
  • عملکرد حرارتی
  • سیستم اپتیکی
  • نرم‌افزار
  • مواد مصرفی
  • خدمات پس از فروش

مدل‌ها و قابلیت‌های هر برند متفاوت هستند و بهتر است انتخاب بر اساس کاربرد واقعی آزمایشگاه انجام شود، نه صرفاً نام برند.

راهنمای انتخاب و خرید دستگاه Real-Time PCR

۱
نوع تست‌ها
قبل از بررسی برند و قیمت، فهرست آزمایش‌های موردنظر را مشخص کنید.
۲
بررسی کیت‌ها
فلوروفورها و سازگاری واقعی کیت با دستگاه را بررسی کنید.
۳
انتخاب کانال
تعداد کانال‌ها را با توجه به توسعه آینده Multiplex انتخاب کنید.
۴
حجم کاری
نمونه‌ها، کنترل‌ها و استانداردها را در هر Run محاسبه کنید.
۵
مواد مصرفی
Tube، Strip Tube، Plate، Optical Cap و Film را بررسی کنید.
۶
خدمات
گارانتی، کالیبراسیون، تعمیر اپتیک، قطعات و آموزش را جدی بگیرید.
۷
دموی واقعی
در صورت امکان یک Run واقعی با کیتی مشابه تست‌های آزمایشگاه انجام دهید.

مواد مصرفی را قبل از خرید بررسی کنید

Tube
Strip Tube
96-Well Plate
Optical Cap
Optical Adhesive Film

دسترسی، قیمت و سازگاری این مواد می‌تواند در هزینه واقعی استفاده از دستگاه تأثیر زیادی داشته باشد.

خدمات پس از فروش را جدی بگیرید

مدت گارانتی
سرویس دوره‌ای
کالیبراسیون
تعمیر سیستم اپتیکی
قطعات یدکی
زمان پاسخ‌گویی شرکت
آموزش کاربر

دستگاه ارزان‌تر همیشه انتخاب اقتصادی‌تری نیست

قیمت اولیه تنها بخشی از هزینه دستگاه Real-Time PCR است. هنگام مقایسه پیشنهادها بهتر است Total Cost of Ownership نیز در نظر گرفته شود.

سرویس
کالیبراسیون
تعمیرات
قطعات یدکی
مواد مصرفی
کامپیوتر
UPS
آموزش
نرم‌افزار یا لایسنس
توقف کار هنگام خرابی

وکتور چگونه می‌تواند در خرید دستگاه Real-Time PCR کمک کند؟

خرید Real-Time PCR معمولاً نیازمند مقایسه چندین پارامتر فنی و تجاری است و مقایسه پیشنهادها صرفاً بر اساس قیمت می‌تواند گمراه‌کننده باشد.

دستگاه Real-Time PCR
UPS
سمپلر
سرسمپلر فیلتردار
Mini Centrifuge
PCR Tube
Strip Tube
PCR Plate
Optical Film
Master Mix
تجهیزات استخراج DNA/RNA
در وکتور می‌توانید برای دستگاه Real-Time PCR درخواست ثبت کرده و پیشنهاد تأمین‌کنندگان مختلف را از نظر برند، مدل، قیمت، زمان تحویل، گارانتی، خدمات پس از فروش و شرایط خرید مقایسه کنید.
💡 تجربه عملی

یکی از اشتباهات رایج هنگام خرید Real-Time PCR، تمرکز بیش از حد روی تعداد کانال‌ها و سرعت دستگاه است. در استفاده روزمره، پایداری دستگاه، یکنواختی حرارتی، نرم‌افزار مناسب و خدمات فنی قابل‌اعتماد می‌توانند اهمیت بیشتری داشته باشند.

همچنین قبل از خرید دستگاه حتماً کیت‌هایی را که آزمایشگاه در حال حاضر استفاده می‌کند و کیت‌هایی را که احتمالاً در آینده اضافه خواهد کرد بررسی کنید. ممکن است یک دستگاه از نظر تعداد کانال مناسب به نظر برسد، اما محدوده طول موج یا نحوه تفکیک کانال‌های آن با بعضی کیت‌ها سازگاری مطلوبی نداشته باشد.

برای آزمایشگاه‌هایی که دستگاه Real-Time PCR بخش اصلی فعالیت روزانه آن‌هاست، سرعت و کیفیت خدمات فنی نیز اهمیت ویژه‌ای دارد؛ زیرا خرابی دستگاه می‌تواند بخش بزرگی از فعالیت آزمایشگاه را متوقف کند.

سؤالات متداول

Real-Time PCR و qPCR چه تفاوتی دارند؟
در بسیاری از کاربردها این دو اصطلاح به یک فناوری اشاره دارند؛ qPCR بیشتر بر قابلیت Quantification تأکید دارد.
دستگاه ۴ کاناله بهتر است یا ۶ کاناله؟
به نوع کیت‌ها و تعداد Targetهای مورد بررسی بستگی دارد. تعداد کانال بیشتر لزوماً برای همه آزمایشگاه‌ها ضروری نیست.
۴۸ Well بهتر است یا ۹۶ Well؟
برای حجم کاری پایین ۴۸ Well ممکن است کافی باشد، اما برای آزمایشگاه‌هایی با تعداد نمونه بیشتر، سیستم ۹۶ Well معمولاً انعطاف بیشتری ایجاد می‌کند.
آیا همه کیت‌های Real-Time PCR روی همه دستگاه‌ها قابل اجرا هستند؟
خیر. سازگاری فلوروفورها، پروفایل حرارتی، مواد مصرفی و الزامات سازنده کیت باید بررسی شود.
HRM چیست؟
High Resolution Melting روشی برای تحلیل دقیق رفتار ذوب محصولات PCR است که تنها برخی دستگاه‌ها و نرم‌افزارها از آن پشتیبانی می‌کنند.
آیا Real-Time PCR نیاز به ژل الکتروفورز دارد؟
در qPCR استاندارد، خوانش اصلی بر اساس فلورسانس انجام می‌شود و معمولاً برای نتیجه‌گیری روتین نیازی به ژل نیست.
هنگام خرید دستگاه دست دوم به چه نکاتی توجه کنیم؟
سابقه سرویس، وضعیت Thermal Block، سیستم اپتیکی، کالیبراسیون، نرم‌افزار، کامپیوتر همراه، قطعات یدکی و امکان ارائه خدمات فنی باید بررسی شوند.
مهم‌ترین معیار انتخاب Real-Time PCR چیست؟
هیچ مشخصه واحدی تعیین‌کننده نیست. دستگاه باید از نظر ظرفیت، کانال‌های فلورسنت، عملکرد حرارتی، سیستم اپتیکی، نرم‌افزار و خدمات پس از فروش با نیاز واقعی آزمایشگاه سازگار باشد.

منابع

  1. Bustin SA, et al. The MIQE Guidelines: Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments. Clinical Chemistry
  2. Kubista M, et al. The Real-Time Polymerase Chain Reaction. Molecular Aspects of Medicine
  3. Applied Biosystems. QuantStudio Real-Time PCR Systems – User Documentation
  4. Bio-Rad. Real-Time PCR Applications Guide
  5. QIAGEN. Rotor-Gene Q User Manual
  6. Roche. LightCycler System Documentation
  7. Agilent Technologies. AriaMx Real-Time PCR System Documentation
  8. Nolan T, Hands RE, Bustin SA. Quantification of mRNA Using Real-Time RT-PCR. Nature Protocols